如何评价这几个面试MIT生物工程系教职的研究

问题描述

精选答案

讲的主要是怎么样通过高通量设计设计最小的蛋白质单元~50aa），来优化已有的模型（Baker实验室的Rosseta），最后提高蛋白质最小单元的设计成功率，在Science文章中，设计了ααα，βαββ，αββα，ββαββ四种基本结构单元（自然界存在），用通用模型开始设计的时候，只有ααα有23%成功率，其它设计基本失败。

在观察已有成功样例基础上，发现在通用模型里，蛋白质疏水性的重要性没有体现（参数修正），在4次迭代后，ααα成功率达到了87%，βαββ，ββαββ成功率都在50%左右，只有αββα依然困难，据此，继续用βαββ作为模板，设计了一系列流感病毒HA的结合蛋白，有超过20%成功率。有些人吹毛求疵，说对于小结构单元的蛋白质模型不能应用于大蛋白质，觉得这种问题非常无聊，对于任何工作，这是一个万能句式，蛋白变大了，用同样方法继续学习优化模型呗。对于一个从设计到应用都完整的工作，觉得这已经非常成功了。